Несмотря на очевидные преимущества, международные железнодорожные перевозки также сталкиваются с рядом вызовов. Сложная нормативно-правовая база, регламентируемая множеством международных соглашений и конвенций, , таких как КОТИФ, МГК и СМГС, создает дополнительные препятствия при оформлении транспортной документации. Кроме того, недостаточно развитая инфраструктура в отдельных регионах может ограничивать возможности по эффективной доставке грузов, что требует от компаний дополнительной подготовки и ресурсов.